奢侈基因名词解释(奢侈基因有哪些蛋白)

基因:产生一条多肽链或功能RNA所需的全部核苷酸序列。

基因组:生物体有机体的单倍体细胞中的所有DNA,包括核中的染色体DNA和线粒体、叶绿体等亚细胞器中的DNA。

C值:通常是指一种生物单倍体基因组DNA的总量。

C值矛盾:生物基因组大小同生物在进化上所处地位的高低没有关系

splicing gene:即真核生物的结构基因,是有若干外显子和内含子相间排列的序列组成的,也称间隔基因或断裂基因。

Exon(外显子):DNA与成熟RNA间的对应区域即氨基酸编码区,非间隔区。

intron(内含子):DNA与成熟RNA间的非对应区域即氨基酸的非编码区,间隔区。

DNA的呼吸现象:DNA复制原点处氢键迅速断裂与再生,导致两条DNA链不断解链与聚合形成瞬间的单泡状结构的过程。

转座元(transposon):DNA上可自主复制和位移的基本单元。

返座元(retroposon):由RNA介导转座的转座元件,在结构和复制上与反转录病毒(retrovirus)类似,只是没有病毒感染必须的env基因,它通过转录合成mRNA,再逆转录合成新的元件整合到基因组中完成转座,每转座1次拷贝数就会增加1份,因此它是目前所知高等植物中数量最大的一类可活动遗传成分

nick translation(切刻平移):DNApolII具有3’向5’外切和5’向3’聚合活性,可切除冈崎片段的引物RNA,可通过加入同位素标记的dDTP作为DNA的标记。

Replisome(复制体):由多种蛋白质组成的复合体,组装成复制叉去分解DNA。

DNA复制(DNA Replication):亲代双链DNA分子在DNA聚合酶的作用下,分别以各单链DNA分子为模板,聚合与自身碱基互补配对的游离的dNPT,合成出两条与亲代DNA分子完全相同的子代DNA分子的过程。

基因敲除(gene knockout):进行功能基因的研究,通过用失活基因经同源重组取代细胞中正常的同源基因,研究被取代基因缺失后的表型可知其功能。

转座子标签(Transposon tagging):转座元的插入可造成基因ORF的断裂,使基因被插入失活,转座元的插入如Tn使该DNA区域带有标记基因可作为标签寻找功能基因。

pseudogene(假基因:与正常基因结构相似,但丧失正常功能的DNA序列,往往存在于真核生物的多基因家族中。

klenow酶:指DNApolII经胰蛋白酶处理后的C-片段,其具有的3’向5’外切和5’向3’聚合活性。

trans splicing(反式剪接)分子之间的一种剪接方式:不同分子的exon相互连接形成新的分子——比较少见

Alternative splicing(可变剪接)50%的基因有这种剪接方式,剪接过程中选择性的保留或去除hnRNA中的某些序列(可能是存在多个 polyA3添加位点、或存在多个promoter位点;也可能是exon或intron的选择性保留)

Enhancer(增强子)真核生物中可提高邻近启动子利用率的顺式作用序列,其功能不受位置(上游或下游)和距离的影响

终止子(terminator)终止子是为RNApol提供转录终止信号的一段DNA序列,需要经过转录后形成茎环结构起作用

启动子promoter基因的一个组成部分,控制基因表达(转录)的起始时间和表达程度

S-Dsequence(S-D序列)原核生物mRNA起始密码子AUG上游7~12Nt处存在一段rich(Pu)(AGGAGG)的区域,能被核糖体小亚基16srRNA识别并结合,可提高翻译效率

readthrough(通读)RNApol在终止子处不停止转录(ρ因子在RNApol停顿时无法及时赶上或其它抗终止因子的作用)的现象

gRNA(指导RNA)一类新的小分子RNA,可以和mRNA被剪辑的部分发生非常规的互补,G-U配对,对mRNA前体分子的编辑起了指导作用

RNA editing有些hnRNA剪接后不能立刻用于翻译,还要进行某些碱基的添加、删除或替换

Ribozyme(核酶)此类RNA自我剪接所必需的小分子能切割mRNA分子,已被用于基因表达的阻遏---阻止病毒的复制;杀死癌细胞; 通过基因表达的阻遏发现新基因的功能

密码子家族

同工tRNA一种氨基酸可能有多个密码子,为了识别也就有多个tRNA,几个代表相同氨基酸的tRNA称为同工tRNA

同义密码 同一氨基酸的密码子

错义突变(missense mutation) : 核苷酸发生改变后其编码的遗传信息发生改变编码其他的氨基酸

密码子 mRNA上每3个核苷酸翻译成蛋白质多肽链上的一个氨基酸,这3个核苷酸就成为密码子

无义突变(nonsense mutation) : 核苷酸改变后变成无义密码,导致编码框提前终止

同义突变(synpnymous mutation):核苷酸突变后其所在密码子仍编码同一个氨基酸(密码子家族)

渗漏突变(leaky mutation) 蛋白质部分失活

S-D序列 原核mRNA5'端非翻译前导序列一段,作为核糖体的识别和结合位点,5’-AGGAGG-3

Kozak序列真核细胞,有效的起始依赖于围绕在起始密码子ATG上下游的一段叫Kozak序列的序列

ORF开放阅读框即从起始密码到终止密码之间的连续的三联体核苷酸序列

molecular chaperone(分子伴侣)是一类能协助初生多肽正确完成非共价折叠又不参与该蛋白质结构组成的蛋白质

多聚核糖体:在一个mRNA分子中结合一定数目的单位核糖体称为多聚核糖体

蛋白质剪接蛋白质内含子的其DNA序列与蛋白质外显子一起转录和翻译,产生一条多肽链,然后从肽链中切除与内含子对应的a.a序列,再把与外显子对应的氨基酸序列以肽键的形式连接起来,成为有功能的蛋白质

Intein(蛋白质内含子)一个蛋白质剪接元件,特点:①.切割位点保守②.具有自动切割加工能力③.具有核酸内切酶活性

extein (蛋白质外显子)

1 cis-acting element(顺式作用元件)

2 trans-acting factor (反式作用因子)

housekeeping gene(管家基因) 在一个生物个体的几乎所有细胞中持续表达的基因,其产物能维持细胞的正常结构和功能。即组成性基因表达

luxury gene(奢侈基因) 只在特定的细胞类型中表达的基因,赋予细胞特异性的功能。即诱导型表达

Gratuitous inducer这类小分子物质通常是operon编码的酶的底物,可被降解,一些诱导物的结构类似物也能产生诱导效应,这类物质不能作为编码产物的底物而被降解,称为安慰诱导物

诱导物(inducer)是一种小分子引发了基因转录约束性的调节蛋白

操纵元(operon)是一个单位的细菌基因表达调控,包括结构基因和控制中的DNA分子所承认的调节基因产物

阻遏蛋白(repressor)一些operon被调节蛋白结合后表达受到阻遏,这类调节蛋白即repressor

Corepressor辅阻遏物小分子物质结合调节蛋白后导致operon的表达受到阻遏,即可阻遏操纵元(repressible operon),这类小分子物质即Corepressor

癌基因(oncogene)表达或过量表达导致细胞癌变(转化),也称为转化基因(transforming gene)

抑癌基因(TSGs) 又名隐性癌基因,是一种抑制细胞生长和肿瘤形成的基因。在生物体内与癌基因功能相抵抗,共同保持生物体内正负信号相互作用的稳定

12 RNAi转录后基因沉默,即RNA干扰

13基因印迹(gene imprinting)

肽核酸(PNA)是一类以多肽委骨架的核苷酸类似物,它独特的结构决定了独特的生化性质,具有很大的优越性,不带电荷,杂交特异性强,能抵抗核酸酶蛋白酶的水解

反义RNA( micRNA)

空转反应 是指当核糖体A位点存在空载tRNA时产生pppGpp和ppGpp的现象

α-互补 载体带有lacZ基因5’部分,它编码β-半乳糖苷酶N-端的146个氨基酸,称为α-肽,载体转化的宿主细胞为lacZΔ15基因型,它表达β-半乳糖苷酶的C-端肽链,当载体与宿主细胞同时表达两个片段时,宿主细胞才有β-半乳糖苷酶活性,使特异的底物X-gal 变为兰色化合物,这就是所谓的α-互补

调控元(regulon):一个调节基因参与多个operon的调节(如SOS系统等)

本底组成型表达 某些操纵元即使被阻遏蛋白结合或无诱导蛋白存在时结构基因也出现低水平表达,这种低水平的表达也叫作本底组成型合成

基因座位控制区(LCR)能使基因在任何位置都表达,具有稳定染色质疏松结构的功能。它与相应的蛋白质因子相互作用可使染色质去组蛋白,保证复制时TF仍与启动子结合

隔离子(insulator)能将染色体分割成互不影响的功能区域得顺式元件,防止阻遏状态或活化状态染色质结构域向两端扩展

RFLP(限制性内切酶片段长度多态性) RFLP标记是发展最早的DNA标记技术,指基因型之间限制性片段长度的差异,这种差异是由限制性酶切位点上碱基的插入、缺失、失重排或点突变所引起的

RAPD(随机扩增多态性DNA) 是建立在PCR基础之上的一种可对整个未知序列的基因组进行多态性分析的分子技术,可用来鉴别个体,常规遗传学分析,群体遗传的研究。多用于植物基因组作图

AFLP对基因组DNA进行酶切,连上双链人工接头,根据接头的核苷酸序列和酶切位点设计引物,进行选择性扩增。它将RAPD随机性和专一性扩增巧妙结合,再选用内切酶以达选择的目的,结合了RFLP和PCR技术的特点,具有RFLP技术的可靠性和PCR技术高效性

SNP(单个核苷酸的多态性) 在不同个体之的基因组之间某一位点的单个碱基不同,在群体中形成了多态性

变性 加热或用碱处理双链DNA,使氢链断裂,结果DNA变成为单链

复性 也称为退火,变性DNA 在适当条件下,二条互补链全部或部分恢复到天然双螺旋结构的现象,它是变性的一种逆转过程

Tm值 双链DNA变性中点时的温度

分子杂交 来源不同的两条单链核酸分子通过碱基互补形成异源双螺旋分子

反向遗传学 在已知基因序列的基础上研究基因的生物学规律,通过功能丧失突变体研究其表型效应。通过同源重组,用突变的基因取代野生型基因,导致功能丧失突变体,进行反向遗传学研究